결제는 분명히 들어왔는데, 입금액이 줄어들어 당황한 적 있으셨죠? 저도 처음 사업할 때 “이 돈 어디 갔지?” 하고 정산서를 몇 번이나 다시 봤어요.
하지만 알고 보면 수수료 + 부가세 구조 때문입니다. 이 글 하나면 나이스페이먼츠 결제내역 보는 법, 정기결제 수수료 계산 방식, 부가세가 붙는 이유까지 전부 정리됩니다.

나이스페이먼츠란?
PG사 기본 개념

나이스페이먼츠 기본 정보
나이스페이먼츠는 온라인·오프라인 카드결제를 대신 처리해주는 PG사(전자결제대행사)입니다.
- ✔ 쇼핑몰 결제
- ✔ 정기결제(구독) 서비스
- ✔ 학원·병원·플랫폼 등
다양한 업종에서 많이 사용하는 대표적인 PG사예요.
📌 핵심 포인트
고객은 ‘상품값’을 결제하지만,
사업자는 수수료를 제외한 금액을 받습니다.
👉 이게 바로 결제금액 ≠ 입금액인 이유예요!
결제내역에 찍히는 항목 구조
정산서 보는 법

정산서 항목 구조
보통 관리자 페이지나 정산서에는 이렇게 표시돼요.
✅ 결제내역 항목 구조
| 항목 | 설명 |
|---|---|
| 결제금액 | 고객이 결제한 금액 |
| PG 수수료 | 나이스페이먼츠에 지불하는 수수료 |
| 부가세(VAT) | PG 수수료의 10% |
| 정산금액 | 실제 입금되는 금액 |
🚨 많이 헷갈리는 부분
❌ “왜 부가세가 따로 빠지지?”
👉 부가세는 결제금액 전체가 아니라, PG 수수료에만 붙는 겁니다!
정기결제 수수료 구조
일반 결제와 뭐가 다를까?

정기결제(자동결제) 수수료
정기결제(자동결제)는 일반 결제와 구조는 같고, 수수료율만 다를 수 있어요.
✅ 정기결제 수수료 구성
| 수수료 항목 | 내용 |
|---|---|
| 카드 수수료 | 약 2.5% ~ 3.5% |
| PG 이용 수수료 | 계약 조건별 상이 |
| 부가세 10% | PG 수수료에만 부과 |
📌 핵심 포인트
- ❌ 고객 결제금 전체에 부가세가 붙는 게 아닙니다
- ✅ PG사가 받는 ‘수수료’에만 부가세가 붙어요
수수료에 부가세가 붙는 이유
이것만 알면 됩니다
💡 부가세가 붙는 이유
이유는 간단해요.
- ✔ PG 수수료 = 서비스 이용료
- ✔ 서비스에는 부가가치세 10%가 부과됨
✅ 정산서에 표시되는 방식
그래서 정산서에는:
수수료 + 수수료의 10% (VAT)
가 함께 빠져나갑니다.
📌 사업자에게 좋은 소식
이 부가세는 👉 사업자 비용 처리 + 매입세액 공제 가능합니다!
세무 신고 시 반드시 챙기세요.
실제 정산 예시
이게 가장 중요합니다

실제 정산 계산 예시
가장 궁금하신 부분이죠? 실제 숫자로 보여드릴게요.
✅ 정산 계산 예시 (수수료 3% 기준)
| 항목 | 금액 |
|---|---|
| 고객 결제금액 | 100,000원 |
| PG 수수료 (3%) | – 3,000원 |
| 부가세 (수수료의 10%) | – 300원 |
| 최종 정산금액 | 96,700원 |
📌 핵심 정리
결제금액 100,000원 ≠ 입금액 96,700원
👉 이게 바로 “돈이 줄어든 것 같은” 이유입니다.
오류가 아니라 정상적인 정산 구조예요!
사업자가 꼭 체크해야 할 포인트
세무 처리까지
✅ 사업자 필수 체크 포인트
| 체크 항목 | 내용 |
|---|---|
| 정기결제 정산 | 월별 합산 정산되는 경우 많음 |
| 부가세 | 매입세액 공제 대상 |
| 정산서 | 세무사 전달 필수 |
| 수수료율 | 계약서 기준 (업종별 다름) |
💡 추가 팁
- ✔ 정산서는 매달 다운로드해서 보관
- ✔ 수수료율 협상은 거래량 늘면 가능
- ✔ 부가세 환급 놓치지 않기 (세무사 확인)
- ✔ 계약서 수수료율 정확히 확인
핵심 요약
3줄 정리
✅ 핵심 요약 (3줄 정리)
- 나이스페이먼츠 수수료에만 부가세 10%가 붙습니다
- 정기결제도 구조는 동일, 수수료율만 다를 뿐
- 줄어든 입금액은 오류가 아니라 정상 정산 구조
📊 정산 구조 총정리
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| PG사 | 나이스페이먼츠 (전자결제대행) |
| 수수료율 | 약 2.5% ~ 3.5% (계약 조건별) |
| 부가세 | PG 수수료의 10% |
| 정산금액 | 결제금액 – 수수료 – 부가세 |
| 세무 처리 | 부가세 매입세액 공제 가능 |
자주 묻는 질문
✅결제금액과 입금액이 다른 이유는 무엇인가요?
PG사(나이스페이먼츠)가 결제 처리 서비스를 제공하면서 수수료와 부가세를 차감하기 때문입니다. 예를 들어 10만원 결제 시, 수수료 3%와 부가세 10%가 빠지면 실제 입금액은 약 96,700원이 됩니다. 이는 오류가 아닌 정상적인 정산 구조입니다.
✅부가세는 왜 따로 빠지나요?
PG 수수료는 ‘서비스 이용료’에 해당하고, 모든 서비스에는 부가가치세 10%가 부과됩니다. 그래서 정산서에는 수수료와 별도로 수수료의 10%가 부가세로 차감됩니다. 이 부가세는 사업자가 매입세액 공제를 받을 수 있습니다.
✅정기결제 수수료는 일반 결제와 다른가요?
정기결제(자동결제)의 정산 구조는 일반 결제와 동일합니다. 다만 계약 조건에 따라 수수료율이 다를 수 있습니다. 일반적으로 카드 수수료 약 2.5~3.5%에 PG 이용 수수료가 더해지고, 여기에 부가세 10%가 부과됩니다.
✅PG 수수료 부가세는 세금 처리가 되나요?
네, PG 수수료에 붙는 부가세는 사업자 비용으로 처리할 수 있고, 매입세액 공제 대상입니다. 세무 신고 시 정산서를 세무사에게 전달하여 환급받을 수 있는지 확인하세요.
✅나이스페이먼츠 수수료율은 어떻게 정해지나요?
수수료율은 업종, 거래량, 계약 조건에 따라 다르게 적용됩니다. 일반적으로 카드 수수료 2.5~3.5% 수준이며, 거래량이 늘면 협상을 통해 수수료율을 낮출 수 있습니다. 정확한 수수료율은 계약서를 확인하세요.
✅정산서는 어디서 확인할 수 있나요?
나이스페이먼츠 관리자 페이지(가맹점 관리 시스템)에서 정산 내역을 확인하고 다운로드할 수 있습니다. 매달 정산서를 저장해두고, 세무 신고 시 세무사에게 전달하는 것이 좋습니다.



